hrvatski | english

PBF.hr / Zavodi / Zavod za biokemijsko inženjerstvo / Kabinet za bioinformatiku / Molekularna genetika biosinteze antibiotika



Molekularna genetika biosinteze antibiotika

Nositelj

ECTS bodovi:
2

Studij:
doktorski

Opis predmeta

Općenito o antibiotički aktivnim supstancijama. Biologija bakterija roda Streptomyces, proizvođača antibiotika (životni ciklus, proces diferencijacije, biosinteza sekudarnih metabolita). Tradicionalna genetika biosinteze antibiotika u vrsta roda Streptomyces. Kloniranje gena čiji produkti sudjeluju u biosintezi antibiotika u vrsta roda Streptomyces. Antibiotici poliketidnih struktura. Porijeklo, biološko značenje i kemijske strukture poliketidnih antibiotički aktivnih supstancija. Molekularni mehanizam biosinteze poliketida. Prostorna organizacija gena što sadržavaju genetičku uputu za poliketid sintaze (PKS geni). Genetika jednostavnih aromatskih poliketidnih antibiotika. Primjer: Molekularna genetika biosinteze antibiotika oksitetraciklina. Genetika složenih poliketidnih antibiotika. Primjer: Molekularna genetika biosinteze antibiotika eritromicina A. Uvod u nove "hibridne" poliketidne antibiotike. Nove "hibridne" poliketidne supstancije dobivene genetičkim inženjerstvom: (a) Pred-kondenzacijskim modifikacijama ugljikova kostura, (b) Post-kondenzacijskim modifikacijama ugljikova kostura. Molekularna biologija i genetika neribosomski sintetiziranih peptida. Primjer: Molekularna genetika biosinteze antibiotika penicilina G. Zaključci i perspektive.

Ishodi učenja:

Nakon odslušanog kolegija studenti će:

  • se upoznati s molekularnim mehanizmima biosinteze antibiotika, osnovnim tipovima antibiotika te njihovim djelovanjem
  • znati osnovne tipove enzima uključene u biosintezu antibiotika, njihovu strukturu i način djelovanja, te metode koje se koriste da bio se povećao prinos produkta ili da bi se promijenila specifičnost enzima, tj. da bi se generirali novi spojevi

Nastava

 

Oblici provođenja nastave:   Sati
predavanja 10
seminari 10
vježbe  

Literatura

 

Red.br. Naziv
1. Hranueli, D., Cullum, J. Novi hibridni poliketidi dobiveni kombinatornom biosintezom. Kem. Ind. (Zagreb),  50: 381-411, 2001.
2. Kumar, P., Khosla, C., Tang, Y. Manipulation and analysis of polyketide synthases. Methods Enzymol.,  388: 269-293, 2004.
3. Finking, R., Marahiel, M.A.Biosynthesis of nonribosomal peptides1. Ann . Rev . Microbiol.,  58: 453- 488, 2004.
4. http://www.biotica.co.uk/
5. http://www.kosan.com/

 

Dopunska literatura

 

Red.br. Naziv
1. Bentley, S.D., Chater, K.F., Cerdeno-Tarraga i sur. Complete genome sequence of the model actinomycete Streptomyces coelicolor A3(2). Nature,  417: 141-147, 2002.
2. Ikeda, H., Ishikawa, J., Hanamoto, A., Shinose, M., Kikuchi, H., Shiba, T., Sakaki, Y., Hattori, M., Omura, S. Complete genome sequence and comparative analysis of the industrial microorganism Streptomyces avermitilis. Nat. Biotechnol,  21: 526-531, 2003.
3. http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_coelicolor/
4. http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp/